Kemudian, pada 2015-2017, Anggito dipercaya memimpin Badan Pengelola Keuangan Haji (BPKH). Setelah itu, dirinya kembali aktif di dunia akademik hingga akhirnya ditunjuk Presiden Prabowo Subianto sebagai Wakil Menteri Keuangan pada 21 Oktober 2024.***